Kræft: Disse 4 gener hjælper med at forudsige resultatet
Omfattende forskning i tumorsuppressor p53's rolle giver en større forståelse af de genetiske mutationer, der er i spil i forskellige former for kræft, samt identificering af fire gener, der kan hjælpe med at forudsige en persons udsigter.
Det TP53 genet er ansvarlig for kodning af, hvad forskere kalder tumorprotein p53 - en tumorundertrykker, der kan forhindre celler i at dele sig og sprede sig for hurtigt.
Forskere har døbt TP53 ”genomets vogter” på grund af dets afgørende rolle i forebyggelse af tumorer og holde celledeling i skak.
Menneskelige kræftformer har ofte mutationer i TP53 gen, der får en af de kritiske defensive mekanismer mod kræft til at mislykkes.
De første undersøgelser, der blev identificeret TP53 mutationer i humant kræft dukkede op i 1980'erne, og siden da har forskere afsat meget tid og ressourcer til at afklare dets rolle i kræft.
Nu bruger den største undersøgelse af sin art tumorprøver fra over 10.000 kræftpatienter og ser på 32 forskellige kræftformer for bedre at forstå rollen som TP53.
Dr. Larry Donehower, professor i molekylær virologi og mikrobiologi ved Baylor College of Medicine i Houston, TX, ledede den nye forskning, der vises i tidsskriftet Cellerapporter.
Fortælling 4 gener kan hjælpe med at forudsige udsigter
Dr. Donehower og team brugte fem forskellige dataplatforme til at udtrække 10.225 prøver fra 32 kræftformer. Ved hjælp af Cancer Genome Atlas (TCGA) var forskerne i stand til at vurdere rollen af p53-banen i disse 32 kræftformer.
Dr. Donehower og kolleger sammenlignede derefter TCGA-dataene med en anden database med 80.000 genetiske mutationer, som Dr. Thierry Soussi - professor i molekylærbiologi ved Sorbonne University i Paris, Frankrig - havde samlet over en periode på 30 år.
Det fandt forskerne TP53 mutationer forekom oftere hos mennesker, der havde et dårligere syn. Desuden fandt analysen, at “Mere end 91% af kræftformer med TP53 mutationer viser tab af begge funktionelle TP53 alleler, ”eller genvarianter.
Dr. Donehower forklarer: "I nogle kræftgener kan du se en kopi af de to gener, der er mistet eller muteret," men "over 91 procent af alle kræftformer mister begge TP53 gener, ikke kun en. ”
Det andet alleltab, skriver forfatterne, opstod ved ”mutation, kromosomal sletning eller kopi-neutralt tab af heterozygositet” - det vil sige gendublering. Den ledende forsker bemærker også, at denne sidste proces opstod meget oftere, end de tidligere troede.
Det er vigtigt, at forskningen også identificerede fire gener, der viste overekspression i mutant TP53 tumorer. Ifølge forskerne kan disse fire gener ”fortælle”, om en kræftpatient har et godt udsyn eller ej.
”Hvis du har et højt udtryk for disse fire gener, har du en patient, der er mere tilbøjelige til at have en dårlig prognose [...] Omvendt, hvis den pågældende patient har et meget lavt udtryk for disse gener, vil han sandsynligvis overleve længere og have en god prognose. ”
Dr. Larry Donehower
”Det giver dig et bedre billede af, hvordan han vil klare det end bare at vide, om han er mutant for TP53 eller ej, ”fortsætter Dr. Donehower.
Endelig undersøgelsen stærkt forbundet TP53 mutationer med genomisk ustabilitet, et fund, der er i tråd med TP53‘S typiske rolle som” genomets vogter. ”
Dr. Donehower kommenterer det unikke ved den nye forskning og siger: ”De fleste undersøgelser af TP53 fokusere på en kræftform. ”
"Ser man på 32 forskellige kræftformer, ser man, at visse mønstre holder op uanset kræftform."
Studie medforfatter og direktør for kræftgenomik ved Baylor College of Medicine, Dr. David Wheeler, kommenterer også betydningen af resultaterne.
Han siger: ”Siden TP53 er en af de vigtigste portvagter i kræftforebyggelse, jo bedre vi forstår dette gen, jo bedre er vi i stand til at forstå kræftens grundlæggende biologi. Det vil føre til bedre terapier. ”
